曾经出现过一种99式坦克增加附加装甲的改进型，这种坦克被称作99式一期改进型，简称99一期改坦克。在99式坦克基本型的基础上，一期改在炮塔和车体正面正面安装了中国第一代坦克附加装甲。
99一期改虽然提高了99基本型的防护能力，但受限于多种因素，其他方面提高较为有限。
（2009年国庆60周年阅兵中的99式坦克方队）
随着新世纪中国多项坦克技术，包括大马力柴油发动机和新型传动系统、防护性能更强大的新型双防附加装甲以及新一代坦克火控系统等的成熟，真正的99式主战坦克，也就是99二期改坦克终于出现。
（2009年国庆60周年阅兵中的99式坦克方队）
99二期改坦克在三大性能上完全达到了西方第三代主战坦克的性能标准，部分指标还有超越。目前，这种坦克仅装备在解放军少数几个精锐集团军的装甲部队。
“三代半”已装备“万岁军”
尽管取得了值得骄傲的成就，我国坦克科研人员并没有停止前进的脚步。在跟踪国外最新坦克技术发展和自主技术创新双管齐下的努力下，中国开始研制99式坦克的深度改进型，起初这一型号被称为“三代大改”。
99二期与99A三期改进型主站坦克对比
99二期改型125毫米穿甲弹弹芯长径比达到了30比1。其单芯长度达到了740毫米，根据1毫米弹芯可以穿透1至1.1毫米的北约重型靶板计算，其穿甲能力至少达到了750毫米。三期弹改用更加强大新型材料和设计，其最大穿甲能力达到约950至990毫米之间。
