第二次伯力会议刚结束，德国法西斯磨刀霍霍，入侵在即。为了自身安全，1941年4月，苏联与日本签订了《苏日中立条约》，苏联的这种做法实质上是与日本法西斯作妥协，严重损害了中国主权和领土完整。《苏日中立条约》不仅对中国抗日斗争造成极为恶劣的影响，也将东北抗联推向极为困难的境地。《条约》的签订导致了苏联对东北抗联政策的改变，它极力阻止入苏休整的抗联部队及时返国作战。东北抗联领导人为顾全大局，同意暂时将主力留在苏联南北野营集中整训，但提出应陆续派遣小股部队回国继续开展游击斗争。尽管这一要求得到苏方认可，但大批抗联部队不能及时重返战场，仍给东北抗日斗争造成极为不利的影响。
苏德战争爆发后，苏联境内的抗联官兵曾提出到苏联西线参加抗击法西斯战争的请求。1941年6月22日，德国法西斯开始向苏联发动全线进攻。与此同时，日本关东军为对苏备战，在东北边境地区展开了号称百万的关东军特别大演习，苏联面临着险恶的严峻形势。周保中等抗联领导人为“保护工人阶级祖国”，尽国际主义义务，曾代表滞留苏境的抗联指战员致信苏联远东军总司令阿巴纳申科大将，表示抗联战士愿意到西线对德国法西斯作战。但苏方并没有同意这种请求，而是让其继续留在原地进行野营整训。
1941年冬，苏联在取得莫斯科保卫战胜利之后，世界反法西斯战争出现转折。在这种形势下，为了适应未来战争形势发展的需要，抗联领导人酝酿将分散在南北野营及远东集体农庄劳动及派遣作侦察工作的抗联人员统一组成一个抗联教导团。这个意见得到了苏联最高当局的同意并决定，扩大编制建成教导旅，列入苏军序列，动员华侨青年入伍，将应征入伍的东方少数民族士兵补充到这支队伍中来，增派苏联军官，以使训练质量迅速提高。教导旅列入苏军序列，可以获得合法的装备、后勤供应，这对东北抗联队伍的发展是有利的。
