主张两岸“三通” 遭陈水扁当局监控调查
综合台媒报道，上世纪80年代，“统一”随台湾经济起飞，蒋经国、李登辉接连赴厂参观，统一集团逐渐成为岛内龙头企业。高清愿曾两任台湾工业总会理事长，连续11年任国民党中常委，并多次建言台湾当局开放两岸“三通”。他认为：“大陆市场幅员广阔，台商到大陆投资是必然的趋势，台湾的经济前景我很清楚，只有跟大陆之间建立在和谐的基础上，对台湾才会有利，虽然我的论调得罪了一些政坛上的大人物，但是一般企业界和老百姓都支持我的看法。”
2000年台湾地区领导人选举前夕，高清愿接受纽约时报采访时大胆预言“阿扁若当选，台股要跌到三分之一”，事后台股真的大跌至3000多点。这个大胆成真的预言，让他得罪了陈水扁当局，也让统一集团在“绿色执政”时期饱受压力。
2002年6月17日，台“警政署”发动全台警察机关对台湾500家大企业进行情报收集、布建工作。积极推动两岸“三通”的台塑集团总裁王永庆、统一集团总裁高清愿，被“警政署”锁定为首要监控目标。台“警政署”保防室副主任黄明得当年受访时说，对王永庆、高清愿这种主张两岸“三通”的台商，必须依法展开调查。
2004年，高清愿获国民党中央委员选举提名第一，但他表态无意参选，从此淡出台北政商圈。即便后来陈水扁当局频频拉拢，高清愿始终在政治上保持低调、无声，企业交棒“第二代”后也鲜少公开露脸，成了政商圈内少见的“无影人”。
胸怀大陆 希望做出中国人的味道
据报道，1991年，台湾开始准许大企业到大陆投资。高清愿随即在第二年派遣166个“统一人”到内地设厂、工作，在与时任天津市长聂壁初会面时，他说，“统一”在台湾已有了25年的历史，迄今还在扩充厂房和产能。而大陆的人口是台湾的60倍，25乘以60是1599，如果大陆能全面开放台资生产的食品内销，“统一”在大陆的投资起码可以持续1500年。截至2013年，除西藏、青海外，统一集团在大陆各省市均建有工厂。
高清愿认为，在经济全球化的浪潮下，企业向外拓展是提升竞争力的基本策略，现在大陆已经成为全球企业竞争的焦点，台商若不能及时布点，等于是把机会拱手让人。如果不是当年台当局政策的阻挠，统一集团在内地早已经有上百家工厂，13亿人口，空间大、机会多，再投资个10年20年都还不够。
2005年11月，高清愿在第三届全球华人企业领袖峰会获颁“杰出企业领袖奖”。领奖仪式上，高清愿用一口闽南腔的普通话这样说道：“我就是希望做出中国人的味道，把最好的东西贡献给十几亿同胞享受”，“两岸如果能够好好合作，21世纪我们中国人在世界上，一定最强。”（来源：中国台湾网 于斯文）
