在中国科学社创立之初,许多章程都由他独立设计,1916年,中国科学会在美国开第一次年会,社长任鸿隽查询了英国皇家学会的资料,才发现这个老牌科学组织的运行与胡明复的设计“竟有许多不约而同的地方”。
有了数学家的称号,中国科学社的会计自然非他莫属。不过看似都和数字有关,但是数学博士毕竟和会计不是同一个门类,胡明复算错的时候也不少。曾有有留心过科学社的账目,发现有时候数目对不上,当然,吃亏的从来不会是科学社,而都是胡会计他自己。根据胡明复的统计,10多年中,他为科学社捐的款项达到了两万多银元,在当时这笔钱可以在北京买到50个四合院。胡明复称自己是科学的“开路小工”,回国之后,他仍然主持中国科学社的社务,长达10年之久。1928年,胡明复在家乡无锡因为有用意外溺水,逝世的时候年仅36岁。