上两图中阴影部分即为双壳体潜艇的上层建筑区域，指挥室围壳也属于上层建筑范畴。潜艇的上层建筑用来容纳柴油机的进、排气管系、高压空气瓶组、可伸缩的导缆钳、带缆桩、系泊羊角、失事救生浮标、救生平台等等多种设备。它还起着连接首尾端结构，保证潜艇外部纵向连续性的作用。其构成的上甲板结构，也是人员在艇外操作时的甲板通道。所以，上层建筑是双壳体潜艇非常重要的，不可或缺的组成部分。
双壳体结构潜艇的上层建筑较大，左边是退役后的国产033型常规潜艇，看着拆的挺惨其实只是拆除了上层建筑和围壳部分。这艘艇也不是要报废，而是重新整修，现在该艇作为潜艇博物馆在上海东方绿洲主题公园展出。右边是在坞修的一艘033艇，也拆除了上层建筑，露出内部众多的管系和高压气瓶等装置。双壳艇的上层建筑空间有多大，大家应该有点概念了吧。
由于上层建筑属于非耐压非水密结构，潜艇在水下时这部分空间处于自由浸水状态。为了保证潜艇在上浮下潜时，水能够自由流畅的进出，上层建筑上就必须开立一定数量的流水孔。上层建筑内自由浸水面积大的潜艇，开立的流水孔数量就多。上层建筑小的潜艇，流水孔开口数量就少。双壳艇因为主压载水舱布置在舷间，艇体宽度增大，为了满足潜艇水下航行性能的需要，保证潜艇线型的流畅，现代双壳体潜艇(国产潜艇采用双壳体结构)的上层建筑和外壳体往往形成光顺曲线，成为一体。上层建筑的体积就较大，内部的自由浸水面积也大。为了保证潜浮时上层建筑内的剩水能够及时的流出，上层建筑上的流水孔开口数量也就较多。
左边涂成阴影的为单壳体潜艇的上层建筑区域，与双壳艇相比上层建筑空间要小的多。而像右边这艘单壳体结构的美国弗吉尼亚级攻击核潜艇，除了一个围壳外就没有其他上层建筑部分，其流水孔就更少，只有在艇首等部位有不起眼的开口。
