考虑到高升号事件牵扯中日英三国，错综复杂，所以美国人也就没再往里掺和。当中国官方抓获石川伍一后，日本多方请求美国设法营救。于是，美国又以日侨保护人的面目出现了。
对于美国有关遣送日本间谍回国的建议，总理衙门明确表示反对。总理衙门在回函中写道：“中日两国现已开仗，战守机宜，关系极重。日本奸细改装剃发，混迹各处，刺听军情，实与战事大有关碍。且虑潜匿煽惑，不得不从严惩治，以杜狡谋而图自卫。来文谓如有奸细即解交就近海口逐其回国，实不足以惩其作奸之罪，亦与公法不符。”被总理衙门回绝后，田复礼干脆直接找李鸿章要人。在给李鸿章的电报中，田复礼说，日本已经声明石川伍一不是间谍，请李鸿章立即放他回国。收信后，李鸿章令盛宣怀代为回复。
盛宣怀回复称，《中日修好条规》中明确规定，两国商民均不能改换衣冠。两国友好时尚且有这样的规定，现在两国已经宣战，石川伍一忽然改换衣冠，假冒华人，藏匿起来是何居心？况且，当日本领事小村回国的时候，中国官方已经问过美国领事田复礼天津还有没有日本人，田复礼说，因为时局不稳，所有在津日本人都跟着小村回国了。现在又冒出来个改装易服的石川伍一，他不是潜伏奸细，是什么？
盛宣怀的回函有理有据，田复礼理屈词穷，无法自圆其说，只好不再对于石川伍一的案子置喙了。
石川伍一案件之后，中美之间又接连发生了几起关于引渡日本间谍的交涉。其中，“上海间谍事件”还在美国国内引起了一场政治风波。美国驻上海领事馆将两名来领事馆寻求避难的日本间谍交给了中国当局，中国依律处死了这两名日本间谍。
美国媒体认为两个日本间谍的死都是因为美国政府对华政策太软弱造成的。为此，在野的共和党还弹劾了身为民主党的总统克利夫兰。一件远在万里之外的间谍案，竟能引起美国国内的政坛地震，这可能是中日美三国当事人都意想不到的。不过，这也说明在一百多年前，中日之间的争端已经不仅仅是两国之间的事，它已经是一个国际事件了。
李鸿章瞒报
虽然李鸿章对美国的干涉给予了回击，但关于石川伍一案，他却始终对朝廷遮遮掩掩。8月13日，石川伍一已经落网10天之久，李鸿章还没有向朝廷奏报这起间谍案。率先把此案揭发出来的是史科掌印给事中余联沅。
8月13日，余联沅奏称：“天津拿有倭人奸细，供出拟用炸药轰火药局，并供京城内奸细亦不少。”一天之后，总理衙门致电李鸿章询问有无此事。一看传闻越来越邪乎，连子虚乌有的用炸药轰火药局都出来了，李鸿章赶紧复电辟谣说：是逮捕了一名叫石川伍一的日本间谍，目前此案正在审理中，确有实据，一定严办。李鸿章为什么迟迟不向朝廷奏报侦破了一起间谍大案？他到底有什么难言之隐？几天后，礼部侍郎志锐的奏折道破天机，原来刘棻的上司天津军械局总办候补道张士珩是李鸿章的外甥。坊间传言，张士珩和许多北洋大员都与石川伍一一案有瓜葛。朝中清流甚至借此抨击李鸿章为通敌秦桧，建议朝廷另“简知兵之大臣，以统其师”。
