F-104C战斗机共有5个外部武器挂架：两个翼尖挂架(No.1和No.5)、两个翼下挂架(No.2和No.4)、1个机身下挂架(No.3)。翼尖挂架是专用挂架，每个最大挂载能力为454 kg(1000lb)，可挂1枚“响尾蛇”AIM-9空对空导弹或1个664L副油箱;每个翼下挂架的最大挂载能力为454 kg(1000lb)，可挂1枚实际重量小于454 kg的炸弹、或1个火箭弹发射器、或1个739L的副油箱;机身下挂架的最大挂载能力为907 kg(2000lb)。在5个挂架中只有No.2~No.4三个挂架可挂载各种空对地武器。
