很显然，此次“深化军队改革”其本质就是要解决这些“多余”问题。其核心绝不是简单的裁撤和合并，而是要根据未来战争的实际需要，将那些不利于战斗力生成的“多余部队”请出去，将那些能够直接转型的部队转为目前所需要的军兵种，同时要强化各个军兵种联合作战指挥体系建设，将改革后的军队建设成为有机融合、战力一体化的信息化部队，而绝不是简单的组合、协同的概念。
毫无疑问的是，“深化军队改革”关键在于顶层设计，即要优化军委总部领导机关职能配置和机构设置，完善各军兵种领导管理体制，强化军队督导机制建设，这是确保军队体制编制改革成功的关键。没有成熟、完善的军队顶层设计，没有军队高层形成的高度共识和大局意识，军队改革都是空谈，也不会有实际的推动力。
打造战区级联合作战司令部
另外，三中全会提出要“创新军事理论、构建中国特色军事力量体系”。中国现行军事战略是积极防御，目前的军事力量体系就是增强打赢信息化条件下局部战争能力为核心，不断提高应对多种安全威胁，完成多样化军事任务的能力。这次军事改革就是要强化“打赢”的能力，新军事理论重在强化应对未来发生在中国周边的诸多军事挑战，如美军的“空海一体战”、“近海控制战略”、日本自卫队的“扩张遏制战略”以及南海声索国的“固守战略”等。对于中国新军事理论就是要立足于现实条件，并具备很强的前瞻性，将维护国家主权和领土、领海完整等国家核心利益作为未来军事斗争的底线，并强化“反介入”作战能力建设，以此为依托强化“军队走出去”战略，强化“军队一体化、信息化作战能力”综合建设。
“新军事理论”中提到的“新”，主要体现在中国需要打造适应今后发展“海洋强国”战略目标的新军事战略。在这个军事战略里面，发展强大的海空军及第二炮兵部队就显得至关重要，积极建设“蓝水战略海军”和“远程战略空军”势在必行，由近海防御向远海防御再到远洋综合作战能力建设方向发展。积极建设“核常兼备”高效有力的第二炮兵部队，提升其“核常双重反击能力”建设更是势在必行，让第二炮兵成为中国军事力量的“拳头部队”和“杀手锏部队”。
“新”还体现在要重点打造能联合指挥控制各个军兵种的战区级联合作战司令部，改革以往的军区体制，整合各军区陆军、空军和三大海军舰队等军兵种力量，打破“各自为战的地域和组织藩篱”，让军队真正形成联合作战能力并最终具备一体化作战能力。
此外，还很有必要整合现有军兵种力量和技术基础，发展符合未来战争需要的“网军”和“天军”部队，通过这些部队的组建，为今后获取全球战场的“制信息权”和“制天权”打下坚实基础。也只有中国军队掌握了更多“杀手锏”武器装备，才能让自身具备打赢不对称战争的综合作战能力。
继续奉行“积极防御”不称霸
“构建中国特色军事力量体系”中提到的“特色”主要体现在，继续奉行“积极防御”的军事战略，“绝不搞扩张、绝不称霸”，继续维护中国特色的军兵种构成，如加强独特有效的第二炮兵部队建设，同时借鉴而不是完全照搬世界军事强国的军队编成和组织经验，最终建立健全适合中国自身需求的军事力量体系。
同时，三中全会还提出了建设“军民融合深度发展”从军民融合角度来看，包括三部分，一是人员的军民融合，应该大力培养军地两用人员，军民之间要形成人才相互培养、交流保障机制。二是从装备的角度，要达到寓军于民的方式，让民间力量能参与武器装备研制，引进竞争机制，让武器装备更加适应未来战场需求，同时还要想方设法把军事技术向民用推广，大力推动“军转民”技术的产业化发展。三是执法维权和军事斗争的融合。现在执法维权主要是由政府来承担，今后要不断加强军队力量和政府力量的结合力度，加强军民执法联动机制能力建设以及信息共享、联合执法保障机制建设都显得至关重要。
