日本社会的主流认知承认发生过南京大屠杀，绝大多数中小学使用的历史教科书上也会讲到南京大屠杀，不过在到底有多少死难者上有不同认识。而用秦郁彦教授的一句话说：“4万人就已经是惨绝人寰的大屠杀了。”
东京审判中，日方的辩护律师明确知道历史真相
绝大多数日本人到1945年“东京审判”时，才知道南京大屠杀事件。尽管大屠杀发生时，全世界就都已经知道日本陆军的残暴。
一般被称为“东京审判”的远东国际军事法庭，于1946年5月3日正式开庭，两年半之后，该庭宣判东条英机以下25名被告全员有罪，7名被告绞刑。
日本的报纸当时只有4个版，但遵照占领军最高司令部(GHQ)的指示，几乎每天都以一半左右的版面来报道东京审判，绝大多数日本人是通过这次审判，才知道了那场以天皇制下面的军阀为中心，财阀、官僚、媒体和右翼一起操作的战争到底是怎么回事。
而东京审判中最吸引人们注意的就是南京大屠杀。事件刚发生时，中国政府发表的信息是，日军第六师团杀害了23万人，十六师团杀害了14万人，其他日军部队杀害了6万人，共计43万人，中国政府一直到东京审判时还是坚持这个主张。
东京审判容许一般人旁听。审判开始后，每周一般有1500名日本人和450名盟国人士参加旁听，而在法庭开始审理南京大屠杀案件时，参加旁听的日本人增加到了2000人以上，这说明了日本人对该事件的关心程度。
从日本人的立场来说，他们很希望能够推翻检察方的指控，但事实使很多日本人失望，被告松井石根大将以及辩护律师伊藤清几乎没有做出什么像样的辩护。
辩护方提出的物证，是当时“国际安全地区委员会”给日军的感谢信，内容是感谢他们没有炮击难民区，以及赠给为难民区运送粮食的日本兵个人的礼物。
这几份证据无法推翻控方提出的大量证人和证词。
辩护方面没有积极采取辩护行动的原因是，辩护律师中有人明确地知道历史真相，为岛田繁太郎担任辩护律师的泷川政次郎，当年在北京就听说了南京大屠杀，他在1938年夏到南京时，特地坐黄包车在市区内兜了一圈，时间已过去半年，南京市内依然随处是被烧毁的民房，黄包车夫告诉他，这都是日本兵烧的。车夫还说，南京市的女人几乎都被强暴过。
