在之后四批歼-11的生产过程中，其最显著特征就是对俄罗斯原料依赖程度的降低。03批和04批除极少数材料还需要从俄罗斯进口之外，大部分机体原材料和毛坯件都立足于国内生产，因此在航空工业业内常常把03批歼-11作为“11号工程”实现国产化的重要标志。另外在生产中还对机上设备与部队的国产地面设备的兼容进行分批改进，例如航管应答机、数据链和导引设备、导航与着陆系统、卫星导航设备等；为了方便中国飞行员和地勤人员的操作，对飞机上的大部分俄文标识和显示数据进行了汉化。
歼-11在生产过程中还有一个常被忽略的改进是各种机载设备以及地面保障设备的国产化，苏-27和苏-30战机立足于国内的装备保障计划也包括在内。由于使用非常频繁加上环境影响，部分俄制战机的机载设备和地面保障设备等附件故障频率远超预计（例如由于一个时期里，全军大量二代机乃至一代机部队的飞行员都来“感受”苏-27，导致机载飞行记录仪磁头报废速度是预计的三倍以上），而部队的修理能力还无法从二代机一跃而升到三代机的水准，追加备件订货也遇到俄方的故意抬价等刁难。所以空军急切希望先研制国产化的配件备件。
两架升级后的歼-11战机，左侧战机加装导弹迫近告警系统，右侧战机可挂载R-77空空导弹
在得知军队的急需之后，国内各相关院所纷纷加快了对俄制配件的研仿进度，并根据备件的轻重缓急以及替代成品的研制进度，分期分批地在歼-11上进行替代件的试飞考核，逐步解决了外场使用上的困难。目前所有现役的苏-27/歼-11和苏-30战机已经完全实现国内自主保障，并融入了中国空军和海军航空兵的作战体系。
机场的歼11战斗机群
交付部队后，这105架歼-11和前后原装进口的70多架苏-27基本不加区别混编使用。由于交付时它们的机载电子设备仍然停留在苏-27SK的标准上，因此在服役生涯中也经历了多次升级改进。最显著的升级是通过对雷达后端部件的改进，它们普遍可以发射R-77型主动雷达制导空空导弹，提高了超视距空战能力。另外近些年一些后期生产的飞机还进行了加装导弹迫近告警装置、微波辅助着陆系统以及兼容各类国产弹药（除空空导弹外，当时引进的俄制弹药并不多）等进一步的子系统改装。
不过在这次阅兵中，歼-11仍将挂载和2009年阅兵中歼-11编队相同的俄制R-27ER和R-73E空空导弹。实际上在阅兵中为了保证安全，不仅受阅空中梯队机型挂载的所有导弹都是不会点火的模拟弹，就连导弹挂架和导弹之间都是完全锁死的，以保证无论发生什么意外情况导弹都不会掉落而导致意外事故。
