对退役核潜艇实行“土葬”，其处理程序通常是，首先需要取出高放射性的核燃料进行最终处置或暂存，之后将核反应堆装置和管路系统去污清洗后拆除、切割、封存，装上驳船运至贮存场，随后统一按照中低放射性废物埋葬。
以美国的处理方式为例，核潜艇退役作业一般在美国海军的皮吉特海峡造船厂实施。在这里，技术人员会对退役核潜艇进行去核处理、切割及装运。从退役核潜艇上取下的废弃核燃料将被运到美国能源部爱达荷国家实验室进行储存，其余的核潜艇艇体将被切割，并装运至华盛顿州的汉福德进行储存。目前，汉福德是美国最大的核废料储存场。
权宜“围葬” 静待处理会有后患
由于“土葬”耗费资金大、时间长，目前大量退役的核潜艇还未完成“土葬”，只能静静地待在指定的位置，等待处理。这就是另一种处理废弃核潜艇的方式——“以废存废”，即将退役核潜艇围入废弃军港储存。这也是美英俄法四国目前普遍采用的处理方式。
不过，这种将退役核潜艇围入废弃军港存放的方法，只能是一种暂时的对策，仍然存在许多安全隐患，万一核力量进入恐怖分子之手，会造成不可估量的恶果。最终，这些在废弃军港里存放的核潜艇仍然需要采用“土葬”的方法进行掩埋。
