1954年2月,胡宗南从“国防大学”毕业,在家赋闲读书。10月,妻子为他生下第二个女儿,胡宗南在家陪妻教子。1955年8月,蒋介石忽然召见胡宗南,说准备派他到澎湖去任防守司令。胡宗南马上起立:“报告总统,我马上到任。”蒋介石手下的几员大将里,胡宗南是最忠于蒋的。看到胡宗南如此爽快,蒋介石很高兴。胡宗南接到任命的第二个月,就告别妻儿上任去了。
1959年10月,胡宗南从澎湖离职回到台北,重任“总统府战略顾问”。1961年,胡宗南65岁。他一向身体很好,从不生病,然而这年的7月,他突然感到身体不适。医生检查发现,他已有高血压、糖尿病症状。几个月后,身体越来越消瘦……这年除夕之夜,胡宗南一家六口团聚一堂。夫人叶霞翟近年不断在报刊上发表文章成为台湾知名作家,4个孩子好学上进,这使胡宗南十分欣慰。到了正月初三,胡宗南觉得身体坚持不住了,进了医院。正月初七,蒋介石到医院探视,胡宗南感激涕零。
2月14日,正月初十,胡宗南突发心脏病,走完他66岁的人生。