第五军的前身是新疆民族军，1954年10月改编成新疆哈萨克自治区军区，后改编成伊犁军区，部队改编为农建师。
第十九军1952年7月1日改编成陕西军区，所属第五十五师调归西北军区，第五十七师改编成中国人民解放军石油工程第一师，其余部队番号撤销。
第九军1952年11月撤销，所属部队改变成新疆农业建设兵团第七、八、九师。
第二军1953年3月撤销，军部整编成南疆军区，所属部队大都整编成新疆农业建设部队。
第六军1953年5月与西北军区航空处合编成西北军区空军，所属部队改编成新疆生产建设兵团的农建部队。
第三十六军1952年2月改编成建筑工程部队，部分部队归兵团直接领导。
第三十七军1952年2月改编成建筑工程部队，部分部队归兵团直接领导。
除了军部撤销外，人民解放军还将大量成建制的作战部队集体转业到地方从事经济建设。
