藏水入疆工程主干道可分为十段，每一段都有水源，工程建成每一段都是一个完整的引水工程。藏水入疆工程主干道路线是：雅鲁藏布江与帕隆藏布-易贡藏布汇合处的雅鲁藏布大峡谷--尼洋河的八一镇--拉萨河的拉萨市--格仁错湖--扎加藏布江的吴如错湖--波仓藏布江的达侧错湖--江爱藏布江的依布茶卡湖--三河并流的戈木错湖--拉雄错湖--牙代苏拉卡河的羊湖--新疆巴音郭楞蒙古自治州且末县奥依亚依拉克乡莫勒且河。
主干道分为十段：第一段是从新疆巴音郭楞蒙古自治州且末县奥依亚依拉克乡莫勒且河到牙代苏拉卡河的羊湖;第二段是从牙代苏拉卡河的羊湖到拉雄错湖;第三段是从拉雄错湖到三河并流的戈木错湖;第四段是从三河并流的戈木错湖到江爱藏布江的依布茶卡湖;第五段从江爱藏布江的依布茶卡湖到波仓藏布江的达侧错湖;第六段是从波仓藏布江的达侧错湖到扎加藏布江的吴如错湖;第七段扎加藏布江的吴如错湖到格仁错湖;第八段是从格仁错湖到拉萨河的拉萨市;第九段是从拉萨河的拉萨市到尼洋河的八一镇;第十段是从尼洋河的八一镇到雅鲁藏布江与帕隆藏布-易贡藏布汇合处的雅鲁藏布大峡谷。
从第一段新疆莫勒且河到牙代苏拉卡河的羊湖建设工程完成以后就可以把牙代苏拉卡河和羊湖水引入到塔克拉玛干沙漠，再完成第二段把拉雄错湖水引入到塔克拉玛干沙漠，这样一直到把第十段雅鲁藏布大峡谷水引入到新疆，每一段工程在地面上都有自己的水源，每竣工一段就是了一个完整的引水工程。
西藏的水资源
藏水入疆工程主干道中间三大水源。第一大水源是雅鲁藏布江与尼洋河交汇处，雅鲁藏布江与尼洋河交汇处海拔2900米，藏水入疆工程主干道到达八一镇是海拔2700米，在八一镇地面上建立水渠，把雅鲁藏布江与尼洋河交汇处90%的水引到八一镇段藏水入疆工程主干道;第二大水源是雅鲁藏布江与拉萨河交汇处，雅鲁藏布江与拉萨河交汇处海拔是3500米左右，藏水入疆工程主干道到达拉萨市的海拔是2600米，把雅鲁藏布江与拉萨河交汇处水引到拉萨市段藏水入疆工程主干道。
第三大水源是以达侧错湖为中心的地面湖泊河流群，把这些湖泊河流通过地面水渠或者冻土层下面隧道连接起来引到达侧错湖进入藏水入疆工程主干道，例如，达侧错湖西南昂孜错、当惹雍错、许如错、扎日南木错、塔若错、扎布耶茶卡、仁青休布错、昂拉仁错湖等等，达侧错湖东北色林错、扎加藏布江、其香错、兹格塘错、玛错湖等等。
在藏水入疆工程主干道上建立二十座左右水电站，完全满足中国西部经济发展需求。从莫勒且河上游海拔1800米向东南开始建设第一段，以后每建设一段海拔就要平均向上抬高100米左右，这样到达取水河口正好海拔是2800米，其实，雅鲁藏布江与帕隆藏布-易贡藏布汇合处的雅鲁藏布大峡谷海拔是2800米以上。这样每段两边的落差都在100米左右，从西北东南2800米向西北每段100米逐步递减，在地下可建立十座水电站。
每段地面上都有自然形成的河流和湖泊，这个落差更大，与工程水渠之间的落差3000米左右，在河流和湖水进入藏水入疆主干道的地面上可以再建十座左右的水电站。其中，雅鲁藏布江大峡谷蕴藏了丰富的水力资源，大峡谷围绕着南边巴瓦峰拐了个马蹄形大拐弯，大拐弯入口海拔2900多米的派区至海拔680米墨脱背崩河段长度约250公里，落差达2200多米。
西藏的高原湖泊
雅鲁藏布江大峡谷河段，河水平均流量达4425立方米/秒，可兴建装机容量达5000万千瓦的巨型水电站，年发电量可以超过3000亿千瓦时，2014年长江三峡水电站2014年全年发电才988亿千瓦时，是长江三峡水电站发电量的好几倍，完全可以满足中国西部经济发展的需求。
发电得到的收入可用于还修建藏水入疆工程贷款资金，更加可以提升西藏经济收入，以后西藏财政不但不需要中央和其他地方政府补贴，还可以用于西藏的投资和建设，造富西藏人民。
藏水入疆工程主干道不但是一个引水项目，还是一个集发电、运输和旅游等为一体的综合工程。藏水入疆主干道是暗渠也就是地下河流，是我们通常说的隧道，在隧道、水电站等基础设施建设上，中国技术是世界一流的，决定没有问题。现在，我们就是要挖隧道，挖一个大隧道，在这个大隧道里面要建设一条铁路和一条公路，用来拉隧道里面的土方和车辆行走，从西北下游向东南上游施工，第一段主干道竣工以后，在铁路和公路外面修建三层透明的玻璃钢，把铁路和公路包起来，第一段主干道地面上水源的水从玻璃钢上面和左右通过，我们再向前对第二段工程施工，第二段工程产生的土方通过竣工第一段工程的透明玻璃钢里面的铁路和公路运输到塔里木盆地，这样一段一段的施工，即不耽误正常引水，又不耽误继续施工，在水电站落闸停水后，我们还可以对隧道进行扩建和维修。在主干道全部竣工后，隧道里面的铁路和公路就会成为西南从雅鲁藏布江大峡谷通过拉萨市到乌鲁木齐市最近的运输大通道，可以收取运输和过路费。我们站在透明的玻璃钢里面向上和左右看就像在海底世界公园一样，也可以发展旅游产业，再为西藏增添一个经济增长点，并且，多增加一个隧道维修费的来源。
