1949年，大陆只有38个特务组织与台湾还有电报联系，这就迫使台湾的保密局不得不重新派遣大批特务以加强对大陆的破坏，但由于失去了组织系统的支持和掩护，这些派遣特务也很快束手就擒。
策动起义
人民解放军在渡江战役后作战的基本原则，就是运用毛泽东确定的天津、北平、绥远三种方式解决战斗。首先就是决不放过一切机会和可能用北平方式争取和平解放。为此，中共中央在1948年专门作出决定，责成中情部主管对敌策动起义工作。这样，策动蒋军起义，尤其在新中国建立前后整地区整建制地策动起义就成为当时的重头戏。在这些起义中比较著名的有：国民党湖南省政府主席程潜和国民党第一兵团司令陈明仁起义，国民党西康省政府主席、川康边防总指挥刘文辉及国民党西南长官公署副长官邓锡侯、潘文华起义，“两航”起义和国民党云南省政府主席、云南绥靖公署主任卢汉起义。
程潜、陈明仁起义。程潜在国民党中资格老，又是当时长沙的主要负责人。陈明仁则直接掌握着长沙的守军。从1948年下半年起，中共湖南省工委、中共上海情报系统和中共华中局社会部就不断派人做程、陈二人的争取工作，并卓有成效。有意思的是，程、陈二人对起义有两大顾虑：一是担心不能得到谅解，希望得到毛泽东的文字保证;二是与前线的第四野战军素无交往，担心长沙解放时受到人格侮辱。为此，华中局社会部专门派员，携带毛泽东致程潜的电报和林彪给程、陈二人的亲笔信赶赴长沙，才最后打消了他俩的疑虑，促使其于1949年8月4日通电起义。
刘文辉等人起义。刘文辉等是国民党四川地方实力派的高级将领，曾经积极堵截过红军长征，但在抗战期间又与中共中央有了联系，对中国共产党及其军队有了一定的认识。经过多年的交往和争取，双方已经有了一定的基础。从新中国成立之时起，中共中央加紧了对刘文辉的争取。 1949年10月18日，刘文辉终于发电请示周恩来，该如何配合解放军的入川行动。
11月间，解放军对四川之敌实行大迂回、大包围，对刘文辉等人所部形成强大的军事压力。 12月9日，刘文辉等人宣布起义。朱德特地致电，欢迎他们参加人民阵营。
卢汉起义。卢汉起义是中共中央、中共南方局、中共华南局，尤其是中共云南地下党长期进行统一战线的结果。 1949年2月下旬，卢汉派与中共有联系的民主人士到中共中央香港分局递交了他致毛泽东、朱德的信，表示反蒋的决心。 5月11日，中共中央要求卢汉派全权代表直接到北平同中国人民解放军总部谈判。同年7月21日，毛泽东对争取卢汉起义作出指示，指出卢汉如能于解放军进入云南时举行起义，宣布反帝、反封建、反蒋的立场，云南问题可以和平解决，卢汉所部可以编为人民解放军序列。1949年12月8日，中央军委发出进军云南的命令。 12月9日，接到中共中央指示的卢汉通电全国，宣布脱离国民党反动派，服从中央人民政府。
