一九二一年，二十六岁的薛岳，任职大元帅府警卫团第一营中校营长。同年五月四日，孙中山以陆海空军大元帅的名义，下达北伐令，薛岳也率领着他的警卫营，随扈孙中山赴广州韶关。谁晓得就在后防空虚的节骨眼上，陈炯明假借北伐的名义，命令所部熊略父子的部队进入广州，紧随熊略部队后头的，还有原本驻扎在西江的陈系叶举、陈炯光、李云复、洪兆麟等部队，全部乘隙涌进广州城，就在一阵混乱之间，广州城全城被陈炯明部队占领。陈炯明向前方的孙中山通电提出要挟，威逼孙先生恢复他的粤军总司令、广东省长的职衔。六月一日，孙中山偕同夫人宋庆龄回师广州，欲好言劝服陈炯明。薛岳率领警卫营一路护卫，孙先生夫妇下榻粤秀楼。
六月十五日傍晚，薛岳事前侦悉陈炯明将于当夜兵变谋反，立刻通知孙中山秘书林直勉、参军林树巍，火速通报孙中山，请其化装成出夜诊的医师，乘黄昏时分，通过叛军哨站，直奔广州天字码头，辗转登上永丰舰。
当天深夜，陈炯明果然称兵作乱。陈逆谋反时，率领之叛军有二、三万之众，薛岳带领他的警卫部队八百多人，坚守广州大总统府，指挥若定，有大将之风。这时，孙夫人宋庆龄尚藏身大总统府左近之粤秀楼，她身边有二十几名卫士保护她。叛军发动数波攻势，都被薛岳所部击退，叛军见久攻不下，准备以煤油纵火焚烧粤秀楼，薛岳急请宋庆龄下楼，并由廖仲恺夫人等陪同，在重重卫士护持之下，将孙夫人安然撤离，与孙先生会合永丰舰。广州大总统府保卫战，一共打了三天三夜，战斗持续到十八日晚间，薛岳才率领残存的两百多人警卫营士兵，向韶关方向突围而去。薛岳这一仗，不仅以寡敌众，而且还制敌机先，事前巧妙安排孙中山突破重围，安然脱身，并在千钧一发危险关头，冒着枪林弹雨护送宋庆龄脱险，对孙中山领导的国民革命运动，无疑是中流砥柱第一功。薛岳智勇双全，给孙先生留下极为深刻之印象。
