不过核动力航母的核动力航母在用作和支持方面的隐形成本也很可观，诚然核动力航母不需要为巨额的化石燃料以及运输费用，不过在轮机部门人员的编制上需要更多的更加专业的业务和训练，相应的这些的的训练费用和薪酬也会更高。
美国海军常规动力航母的轮机舱人员编制在600人左右军官20人上下，而核动力航母的轮机舱人员编制组有750人左右，军官30名。
常规航母士兵士官中多为下士而核动力航母的轮机舱军士则多为中士。
不过近些年随着原油价格的增长，美国海军有报告成如果原油价格持续增长那么常规航母的运行成本将超过核动力航母。
但是正如前文提到的，核动力航母的“换料和整体全面大修”让核动力航母的耗费长时间躺在船坞中，在航率也就无可避免的出现缩水，这就大大增加了核动力航母在航率的使用费用。
中国海军在大型核动力航母方面缺乏积累，第一代核动力航母的研制代价肯定会比常规航母要高。
而中国在航母的使用用途与美国不同，美国所经营的是全球霸权，这就决定了美国航母长时间高强度的部署于海外。而中国则立足于国防需要，奉行积极的近海防御和远海护卫战略。
