日本政府称钓鱼岛隶属冲绳县。然而，冲绳被日本吞并之前的琉球王国共有36岛，其中根本不包括钓鱼岛。日本人林子平1785年在《三国通览图说》中便附有琉球三十六岛图，并用不同颜色标出了钓鱼台、黄尾山(黄尾屿)、赤尾山(赤尾屿)。1805年日本的《琉球三十六岛之图》也把琉球的36岛逐个划在圈内，而把中国台湾省的钓鱼台、黄尾山、赤尾山与花瓶山、彭佳山并列画出，并特意在其上端各画上一个小圆圈，以示与琉球36岛有别。
据中国学者鞠德源考证，1838年前后，由于负责接待清朝册封使的琉球人错把那霸西部近海“庆良间列岛”中的“久场岛”和“久米赤岛”的名字套用在黄尾屿和赤尾屿上，不仅误导了当时清朝的册封使，还被1885年日本明治政府觊觎钓鱼岛所利用。不过，就连当时接受日本政府密令调查钓鱼岛的冲绳县令西村舍三都觉得此举不妥。他曾在调查报告中表示：“久米赤岛、久场岛及鱼钓岛为古来本县所称之地方名”，但该岛“恐无疑系与中山传信录记载之钓鱼台、黄尾屿、赤尾屿等属同一岛屿。若属同一地方，则显然不仅也已为清国册封原中山王使船所悉，且各附以名称，作为琉球航海之目标。故是否与此番大东岛一样，调查时即立标仍有所疑虑”。由于日本动词在宾语之后，所以钓鱼岛被日本改为“鱼钓岛”，但直到二战后日本一些官方文件和地图仍使用黄尾屿、赤尾屿等中国岛名。
日本把钓鱼岛列岛改称“尖 阁列岛”，最早是把《英国海军水陆志》海图中的“Pinnacle Islands”翻译为“尖 阁群岛”，1900年才称“尖 阁列岛”。这比中国命名至少晚了近500年。
