这两步过程使用的只能是军舰，这两段路却有很大的危险性，因为虽然日本海军在美军的打击下几乎已经没有了战斗力.
但是，日本海军却仍有相当数量的潜艇，即使在战争末期这些潜艇仍然偷袭美军的军舰.
即运送原子弹的军舰随时有可能被日本潜艇偷袭，美国怎么会冒那么大的风险用军舰运送原子弹？
“幸存者”的迷惑。从战争结束到今天，从未发现过一个可以直接证明在广岛和长崎有过原子弹爆炸的人。
有些“幸存者”只看到有大火产生，另一些“幸存者”以自己所谓“受到辐射烧伤的”伤痕，实际上只是火烧伤的痕迹。没有一个日本人能以自身经历的证据证明在广岛和长崎曾爆炸过原子弹。
美国和德国科学家在广岛和长崎两地进行了土样品的秘密采集，拿回国后经化验发现这些土的土质与普通土几乎没有区别，辐射计量并非超常。
根本无法与在原子实验基地所采集的土样品的辐射剂量相比。实际上，在受到严重辐射的土上在几百年内不可能生长植物，人在该地区生活险，这与今天广岛的事实相悖。这更使人们困惑。
最有力的证据。美国、中国和澳大利亚的科学家运用巨型计算机的有限元分析法，对在新墨西哥州、广岛和长崎的原子弹爆炸的电影图象资料进行分析后，其结果令他们大吃一惊
三份图象是同一颗原子弹的，也就是三份电影资料是在同一颗原子弹爆炸的不同角度拍摄的，当然应该是在新墨西哥州爆炸的那颗原子弹.种种令人不解的疑问和新的发现令许多科学家（特别是物理学家）和历史学家十分困惑.但是，由于这种关于原子武器的事件的极其特殊性以及对事实的谨慎态度，另外很多科学家和历史学家都是独立研究，使这种疑问没有通过新闻媒体公布于众。
