美海军海上系统司令部(NAVSEA)正在致力于推进F-35C与航母的整合工作，以便将来的F-35C能够更稳妥地在航母上进行服役。目前这项工作仍存在一些挑战。
在该整合工作中，美海军首先需要克服的困难是F-35C飞机的F135发动机加力涡扇发动机的尺寸问题。美海军航母项目执行官、海军少将ThomasMoore指出。“由于该发动机尺寸巨大，从后勤保障规模角度看，应对该发动机本身就是一大挑战。”由于航母建造周期长、造价高、更新慢，因此，每种航母在其寿命周期内都会遇到如何适应新配备的武器系统的问题。正如Moore所说，“尽管F-35C带来它自身特有的一些挑战，但这也并非我们从未遇到的问题。”
美国F-35C战机资料图
美尼米兹级核动力航母目前尚没有根据F-35C的需求进行改装，但这种排水量达10万吨的巨型战舰迟早也需通过改装才能适应F135的需求。同样，美军海上运输司令部(TheMilitarySealiftCommand)所属的货运船只也需要通过改装才能运输F135。而新生产的福特级航母已经预见到这种需求，该类航母在设计之初就已经考虑了容纳大型发动机的问题。
