预算也一再超支。据美国《华盛顿邮报》报道，该项目最初被五角大楼批准时，洛·马号称发展并制造2852架飞机需要2330亿美元。而五角大楼现在估计总额将达3971亿美元。
专家认为，“三合一”的研发模式是造成F-35难产的重要原因。
虽然美国最初打算让三军的F-35具有70%的通用性，最终三种战机通用的部分只有30%。
让一种15吨的单发飞机，完成其中任何一项任务都是世界性难题，而美国人却要它完成3种任务完全不同战机的任务，特别是短距起飞/垂直降落，必然导致成本、拖延等问题出现。
未来十年对中国威胁最大的隐身战机尽管因为问题不断饱受外界质疑。
但有中国军事专家认为，未来，F-35将成为世界特别是亚太地区装备数量最多的五代机，某种程度上，F-35对中国的威胁甚至比F-22还大。
和高端机型F-22A相比，F-35虽然属于“低档”型号，但却可能广泛装备中国周边国家，其中就包括日本和韩国。
日本防卫相小野寺五典前不久参观美国的F-35战斗机工厂时表示，关于航空自卫队配备42架F-35的计划，有可能根据价格研究增加采购数量。
如果F-35能赶在中国歼-20之前装备日本航空自卫队，那将改变中日之间的空中平衡，更重要的是，将赋予日本航空自卫队梦寐以求的隐身对地打击能力。
另外，对于F-35的性能也不应低估。
F-35不具备F-22A的超音速巡航和超机动性，但在各国在研的五代机中，性能仍堪称出类拔萃。
尤其是隐身性能，美国在这方面实力雄厚，而在雷达、火控以及机载武器方面也都走在世界前列。它在空战中，特别是中距空战中不逊色于任何对手。
相比之下歼-20在大推力发动机诞生前，并不占优势。尽管F-35一路磕磕绊绊，但是目前已经装备近100架，威胁近在咫尺。
