商务部和外交部是该指导委员会的双主席，指导委员会办公室则设在商务部西亚非洲司。
指导委员会每年召开1-2次会议，在政策层面给予基金指导，不干预基金的日常经营管理。但是如投资项目涉及我国重大、敏感外交、经济政策，基金则先听取指导委员会意见。
中非发展基金作为国开行的全资子公司，可以与国开行共享项目资源，从中非发展基金以往运作的项目来看，很多项目都得到了其母公司的贷款。
与此同时，国开行也为基金投资项目提供融资支持，发挥投资与贷款的协同效应。除了正在推进的一般股权投资外，中非发展基金也在探索一些新的投资方式。
鲁庆成在宣介会上就表示，中非发展基金已经与一些中国的私募基金和国外的投资机构就合作投资进行过探讨。
“如在该基金下面设立子基金，与中国的私募股权投资公司合作成立子基金专门投资一个领域；或与非洲当地政府、私募股权投资公司、金融机构或企业探讨成立子基金，共同投资非洲某一产业或项目。”
