裕仁对南京大屠杀非常了解，1938年1月，裕仁的表弟、驻德国代表贺阳宫邦宪访问南京，归来向裕仁报告南京惨状，裕仁无动于衷。他的胞弟三笠宫崇仁亲自向他报告南京日军暴行，他亦并未予以干预和制止。三笠宫崇仁亲王是裕仁最小的弟弟，他对日军在南京的暴行曾痛心疾首，并向裕仁谈到南京的情况，还让他看了中国拍摄的有关日军在华暴行的电影片。1944年，三笠宫曾撰写谴责日军在华暴行的讲话稿，但日本军方禁止公布他的这一讲话稿，并将其没收销毁。1994年6月6日《读卖新闻》采访已成为历史学者的三笠宫，谈到上述情节，但可惜没有谈及当时裕仁的态度。事实证明，裕仁对南京大屠杀是不反对的，相反，还对日军参与屠杀的高级将领予以嘉勉。1938年2月12日，朝香宫回国复命,裕仁就在皇宫接见并对他的屠城“战绩”大加赞赏，特赐雕有日本皇室菊花纹徽的银质花瓶一对，以示褒奖且因“战绩”恢复朝香宫的皇室身份。他的军衔也因屠杀“有功”而被晋升为大将。在此之前，裕仁闻听朝香宫率军攻陷南京，曾向日本大本营参谋总长、也是他叔父的闲院宫亲王谈到，对朝香宫在南京的行动异常满意。闲院宫据此向朝香宫发出贺电：“战绩卓著，史无前例”。此后，朝香宫与裕仁的关系更加密切，经常会晤，也一同打高尔夫球。2月26日，裕仁同时接见了南京屠城的两个元凶松井石根、柳川平助，对他们攻克南京，予以嘉勉，也各赠一对皇家菊花纹徽银瓶以示褒奖(其实，松井于1937年12月17日到19日只在南京住了三天，而大部分时间直接在南京指挥屠杀的则是朝香宫)。
