但《产经新闻》披露，美国如今宣称“如果要按期交付4架战机，就无法保证性能”，因为美国方面的研制进度落后，日本要求搭载的最新机载软件还未完工，该软件可以让僚机、军事卫星、宙斯盾舰等平台共享信息，迅速把握空中战斗情况。美方认为，如果战机按美日双方达成的协议交付日方，则有可能出现机身组装不全，管理权由美方控制的情况。此外因为美国为海军、空军和海军陆战队同时开发3个型号的F-35，其中一个型号出现问题则需要对3种机型的机身、软件进行修改，所以也造成F-35生产时间延长。报道称，如果美军按要求对F-35的性能测定完毕并最终达到量产，日本将要等到2019年以后。这意味着F-35战机服役前的3年间，日本防空体系将“不可避免地出现漏洞”。
更让日本难以接受的是，美国军方人士还称“因为F-35开发延迟以及盟国削减购买数量，F-35对美军的售价将提高，对日本的售价当然也要提高”。由于F-35的研制进度多次延期，而且受经济危机影响，西方多国大幅减少军费开支，削减原先的战机采购数量，导致F-35的单价也不断增加。日本政府原本估计F-35的采购单价为99亿日元，但美国国防部4月向国会递交的报告称，向日本出售的42架F-35总价为100亿美元，再加上飞行员培训和其他费用，最后平均一架F-35的价格在2.38亿美元左右。尽管日本多次提出希望美国不要涨价的请求，但由于F-35价格持续上涨，因而不得不接受涨价数亿日元的现实。美国国防部人士接受《产经新闻》采访时，也对F-35的交付时间和价格避而不答。
日本共同社14日称，日本政府在2012年度预算中列入包括训练机等在内的首批4架F-35的采购费用共计600亿日元。至于单价上升，日方考虑通过削减相关经费来维持原有的预算额。日本政府计划共采购42架F-35，但让日本政府难以安心的是，剩余38架的采购费金额目前完全无法预测。由于F-35的其他共同开发国近日不断调整采购计划，未来该机价格仍有可能上涨。尽管如此，但日本政府仍打算接受美国的涨价。日本《每日新闻》14日晚称，日本政府已针对F-35提价一事，决定接受美国的要求，预计6月将签署正式合同。
