第三层为末段拦截层，主要通过红旗-9B和红旗-29等导弹进行末段拦截。由于红旗-9导弹已经多次出现在国内阅兵式以及各种武器展中，这里并不再做描述，下面主要说一说红旗-19和“动能”系列拦截导弹。
网络上流传的红旗-19拦截导弹的发射画面
根据中航工业公司2000年的一份公开文件，中国当时已经将红旗-19列入了其“五年计划”和863科技发展计划。文中提到的一些细节，如在大气层内外均可实施拦截，推力矢量控制的动能杀伤器战斗部等，让当时的观察家相信这种导弹可能与美国THAAD导弹类似。而《解读军报》公开发表的文章中曾透露，红旗-19导弹于2003年首次试射，2009年定型。中国知网上的部分论文也曾提及红旗-19的编号名称及该弹使用35公斤级动能杀伤器作为战斗部。就在外界对红旗-19百般猜测时，网上突然了出现一张模糊图片，这是一枚外型与目前已知各型中国防空导弹外型迥异的新型导弹。据发图者称，这枚导弹就是红旗-19导弹。如果中国红旗-19导弹真实存在并进入部队服役，那么意味着中国在大气层内外和大气层边缘的反导拦截能力已经接近或超过美国，达到世界领先地位。
网友拍摄到的中国反导试验景象，所用导弹估计为“动能”系列
“动能”系列拦截导弹可以说是目前中国反导拦截技术的最高水平，这个系列的导弹大致类似于美军的GMD系统。美军GMD系统即陆基中段导弹防御系统，是在敌方弹道导弹尚未到达目标之前，在其飞行弹道中段，也就是太空中对其进行拦截并将其战斗部摧毁。美军视其为遏制中俄朝弹道导弹的“杀手锏”，其已经进行了大量的试验并进行了初步部署，不过，就试验情况来看，GMD系统的拦截成功率并不是分尽如人意，需要改进的地方还有需要多。而中国“动能”系列拦截导弹于2010年01月11日在境内进行了一次陆基中段反导拦截技术试验，所使用的动能-1型导弹的成功在大气层外击毁来袭弹道导弹，自此中国成为继美国，俄罗斯之后世界上第三个掌握陆基中段反弹道导弹技术的国家。2012年10至2013年5月，中国在境内再次进行数了陆基中段反导拦截技术试验，其所用导弹外界估计为动能-2型拦截导弹，试验达到了预期目的。可见，虽然中国启动中段反导试验的时间虽然较晚，但进步速度却非常快，假以时日，中国的中段反导系统将成为可比肩甚至超越美军GMD系统的存在。
历经半个的世纪的发展，中国在反导领域不论是远程预警雷达还是拦截导弹，都取得了长足的进步。在国际局势风云变幻的今天，中国的反导系统只有擦亮眼、握紧剑，才能使得我们有足够的资本来对付某超级大国的霸权主义与核讹诈。“革命尚未成功，同志仍需努力！”中国反导系统还有很长一段路要走。
