一年来，苏南减少了太湖养殖，让螃蟹为太湖治理让路；制定了与国际接轨的排污标准、启动了排污权交易；大力倡导发展科技含量高、经济效益好、环境污染少的现代服务业，发展思路越来越宽。
同时还采用退耕还林、退渔还湿方式，在环太湖区建造以抗污染、耐水湿树种为主，乔灌草结合，生态功能齐全的防护林带，并通过种植水生植物，形成稳定的水生植物群落，利用生物和化学手段来达到减少水体氮磷总量、改善水质的目的。
无锡市还提出到２００８年底沿湖２００米范围内建成生态湖滨带，到２０１０年底，沿湖纵深５公里范围内建成生态循环经济带，并投资２９亿元，力争到２０１０年恢复性建设太湖湿地４万余亩。目前，无锡市正加紧实施太湖湖滨湿地建设工程、太湖生态防护林建设工程、水生植物放养种植示范工程和净水渔业示范工程，四大工程联袂保护太湖湿地。
为了从根本上恢复太湖的生机，江苏省政府还将太湖的铁腕治污工作分解落实到沿湖５个省辖市，并签订了年度目标责任状并落到了实处。
记者在采访中了解到，由于太湖治理涉及多个区域和部门，条块分割造成“多头治水”的体制性问题。有关专家认为，在治理太湖的具体措施上，相关部门之间的步调有时候不一致，甚至出现扯皮现象。一直以来，治理太湖的思路更多的是强调流域治理，希望通过对太湖水域的科学治理，解决太湖富营养化问题。事实证明，“就水论水”治不好太湖。治理太湖必须把流域治理和区域治理结合起来，打破行政区划，进行区域统筹。 应尽快建立跨部门、跨地区的负责太湖综合治理的行政管理部门，统一协调治理步骤，全面、科学、长期地对太湖生态环境进行综合治理。
长期关注太湖治理的中科院南京地理与湖泊研究所研究员秦伯强说，记住太湖蓝藻的深刻教训，自觉认识和把握生态建设规律应该是这次事件的教训，庆幸的是，人们开始用敬畏自然和反省自己的态度去深刻反思太湖蓝藻的告诫，开始建设生态文明，促进和谐发展。
