在当时，牛根生和蒙牛的人并没有出来解释，导致外界的各类信息疯狂传播。“由于大众对2008年的真实情况了解不够准确，导致彼此的信息不对称，所以没有办法和外界进行有效的交流和沟通。如果牛根生接受外界对真实情况的歪曲，与他良心不符;不接受，也不是他一个人可以扭转。”雷永胜表示，“他也希望未来有合适的时间、合适的机会可以专门和大家聊一下这个话题。”
一位行业观察者曾表示，三聚氰胺事件，“伊利里没有像牛根生这样的‘神’，人们却把伊利在这场风波中的仇恨给淡化了。”不仅伊利，其他任何一家乳品企业，都没有牛根生这样的“神”，他们所应承担的责任，自然都被淡化了，而牛根生这尊“神”，则被放大。
辞职之后，蒙牛产品一旦出现问题，牛根生就会被“揪出”。而在2013年四川雅安地震之后，壹基金公益基金会受到广泛认可并从社会各界得到捐款时，网络名人王小山等看到牛根生亦是壹基金的理事后，声称抵制。对于持续不断的质疑甚至谩骂，牛根生表示都能够理解和包容，“因为他们是想让我更好，想让中国乳业更好。我想他们并不是针对我个人，因为我们没有个人恩怨，也没有任何工作关系、利益关系、亲戚关系。所以我更多的是通过这些‘关注’，对自己进行剖析、鼓励和提高。”
至于牛根生1999年创立的蒙牛对中国商业的功与过，雷永胜认为，最起码通过蒙牛的创立和发展，推动了中国乳业的发展，培养了一大批乳品企业的管理人才，同时也推动了国人喝牛奶的意识形成。至于功过是非，牛根生不好说，只能任人评说。
捐出股份：欧美模式中国玩法
困厄牛根生的除了三聚氰胺，还有沸沸扬扬的“万言书”，以及他的眼泪。2008年11月，三聚氰胺事件爆发三个月后，媒体披露牛根生的一封私人网络邮件：《牛根生致中国企业家俱乐部理事及长江商学院同学的一封信》。媒体提供的信中显示，牛根生声泪俱下向企业家朋友求援，希望得到现金支持，否则蒙牛将被外资投行掌控。从“牛根生落泪求援，万言书揭蒙牛陷入质押危机”，到“联想2亿助蒙牛脱困，解除质押危机”，再到“联想根本救不了蒙牛，大摩稳操蒙牛控制权”。各种消息莫衷一是，曲折跌宕。牛根生的眼泪更被视为“鳄鱼的眼泪”，遭到鄙视。
雷永胜告诉《中国慈善家》，牛根生的眼泪，纯属子虚乌有，“第一，牛根生是强硬派的性格;第二，商场上能相信眼泪吗?”据雷永胜所知，牛根生创办蒙牛之后只掉过一次眼泪。2004年，有人向蒙牛成品投毒并发送匿名恐吓信进行勒索，未果之后，湖北、湖南和广东等地接连发生蒙牛牛奶含有甲醛事件。此后，多地均被散布“蒙牛牛奶含有甲醛”的消息，一时间事态几近失控。“三聚氰胺事件是人为在原奶里掺假，这次事件是人为在成品里掺假敲诈。”就在牛根生等企业高层认为企业快没戏的时候，峰回路转，事件引起国家高层领导的注意，国务院责成公安部亲自部署破案，还蒙牛以清白。牛根生在企业重生之际，百感交集，为此流下了眼泪。
而对于万言书的报道，雷永胜说，媒体报道不但是断章取义，而且整个报道有八、九处是捏造的。“三聚氰胺最起码是产品的问题。媒体说是借钱去救蒙牛，根本不是这么回事。蒙牛当时账上有几十个亿的现金，因为问题小所以赔偿是最少的，根本不存在财务威胁。”三聚氰胺事件发生后，一些企业家朋友纷纷询问牛根生真实情况，囿于电话中说不清楚，以及为了向更多朋友说明白，牛根生口述，助理笔录，整理出一份关于三聚氰胺事件的前因后果，通过电子邮件发送给朋友，以示通报。
万言书中提及的求援，真实情况则是为了牛根生捐赠的股权。此前，牛根生已经宣布将他持有的上市公司中国蒙牛股份捐给老牛基金会，为了保证管理层对企业有一定的控制权，牛根生捐赠的股份不宜卖入公开市场套现，为了让基金会获得可以使用的资金，除了套现之外，还有一种办法，即盘活法。牛根生将自己持有的一小部分股份质押到投行，获得股票价值60%的贷款额度，用这部分款项投资获取回报后，用于慈善事业。三聚氰胺事件导致蒙牛股价大幅下跌，金融危机又让持有质押蒙牛股票的银行自身岌岌可危。于是，柳传志、俞敏洪等人纷纷临时拿出大笔现金，置换出在银行质押的蒙牛股票，从而避免股票被卖掉而被外国企业收购的危险。
2010年12月28日，牛根生捐出持有的中国蒙牛股份68781022股，占中国蒙牛股份的3.96%。因为无法直接捐赠到境内的老牛基金会，所以交由第三方信托机构负责管理。2011年7月13日，这部分股票转让中粮，获得现金金额为17.36亿元港币。
在这之前，牛根生捐出了持有蒙牛集团的所有股份。由于《公司法》规定公司董事每年转让股份数量不得超过25%，所以牛根生先生的捐赠是逐年办理法律手续。2006年1月2日，捐出蒙牛集团股份5348590股;2008年12月16日，捐出蒙牛集团股份16045770股;2010年5月28日，捐出蒙牛集团股份39573888股。
早在2002年，牛根生和他的团队考虑蒙牛上市时，牛根生就开始规划公司上市后所获巨额财富如何支配和使用。2003年，在北京天伦王朝饭店，牛根生、雷永胜、蒙牛集团党委书记卢俊和律师杨育红四个人碰面，以非正式的形式第一次探讨了成立慈善机构的可行性。2004年蒙牛在香港上市，《福布斯》给出牛根生当年的身价为1.35亿美元。就在这一年，牛根生在内蒙古成立“内蒙古老牛公益事业发展促进会”，这是一个社团组织。也是在这一年，《基金会管理条例》出台。不过牛根生开始操作成立基金会时，该条例尚未出台，经过咨询有关部门及律师等意见，先成立了公益事业发展促进会，在下面设立“老牛专项基金”来做慈善。2005年，牛根生对外宣布捐出个人持有的所有蒙牛股份，捐赠到老牛基金会。
在蒙牛“火箭般”速度的发展中，牛根生捐出了自己所有的股份，意味着他突然成为巨富之后，钱还没有到手，又立即放弃了。在中国，这样的选择和决定，直到今天仍无第二人。“这是我对自己人生的一个规划。”牛根生说。在他的规划中，前半生做商业，是通过度己来度人，后半生做慈善，是通过度人来度己。再细化，他给自己设立了一个人生三段论：020岁，学习阶段;2050岁，创业阶段;50岁至老，贡献阶段。在这样的规划中，50岁，即2008年，他要实现从企业家到慈善家的转型。
