涉嫌bug之：国安不见超能力 间谍实在太无敌?!
不仅是憋屈，剧中的国安“大隐隐于市”，而隐藏中似乎不见行动，更没有“王牌特工”的超凡能力，这样的平凡才靠谱?在质疑中，也不乏网友先行反驳：“在和平年代的反间谍形势下，国安面对的敌人就不是舞刀弄枪的，真实的斗争就应该是无声的较量，所谓于无声处、于无形处。”
网友从专业角度分析，《于无声处》讲述的是上个世纪八十年代的故事，早就不是战火纷飞的年代，更不可能有诸如拳脚功夫、刀枪火拼的传奇性情节，如果真是飞檐走壁、无所不能的话，可能就违背了真实性原则，而那些在隐藏很深后发现问题、发现线索的人，往往是国安人侦察案件的常态。隆晓辉则认为，创作者首先应该尊重历史的真实，在真实的基础上才可以做适当的艺术发挥，不能为猎奇博眼球，太过夸张甚至无中生有。
相比国安工作人员，赵峥扮演的间谍乔敬堂显得无所不能。不仅能操控国家级学术杂志，刊登陈其乾的论文帮他留在厂里，还能在医院中随心所欲给冯书雅的母亲下药，旨在撮合陈其乾与她的婚姻，如此手眼通天，尤其在对比之下，岂不太夸张?“这部剧里的‘王牌特工’是间谍们，形象略高能，能力更高能。
再看看门齐大爷之前隐蔽的多好，间谍这么牛，真相你怎么看?”也有不同意此观点的网友认为：事实上，和平年代的间谍与反间谍斗争，其实是两个国家的较量，往往一斗就是几十年，因此，须了解敌人的强大，不能轻视间谍组织的生存能力与手段。
于无声处出Bug 国安超能力失效间谍太无敌 精彩
涉嫌bug之：看到谁是嫌疑人，就是不抓?!
在剧中，明明发现间谍嫌疑人却迟迟不行动，观众坐不住了：“不动手嫌疑人不就跑了，炸弹都要引爆了还不拦着，这是在逗我?”“国安不应该更霸气么，涉案剧里，我们的干警早就行动了?”
事实上，这样的设计正是出于对国安特质的考量，对真实工作方式的呈现，有专业人士解释道：“简单说，对于通常涉案剧情节，只要某人存在嫌疑，公安部门均可要求对方配合调查。但是，由于国安剧里，是国家之间的较量，牵涉的不是几个人那么简单，所以他们的每一步行动都要以最终破获案件为终极目标。
