因三次“”而在1958年的军委扩大会上受到批评,扩大会结束后,调到军事科学院任副院长,不再担任总参谋长。
自行布置准备攻占马祖列岛
1955年6月20日深夜,彭德怀接到南京军区急电,说皮定钧(福建军区副司令、中将)从北京回来传达总参谋长6月18日指示:“对马祖列岛的作战方针:应该是全面准备同时连续攻击高登、北竿塘、南竿塘。只准打好,不准打坏,以显示我国力量的强大,战斗实施应速战速决,准备工作应细致周到,并向最困难处着想。限今年内完成解放马祖列岛的作战任务。”
彭德怀看电报后感到惊异。便把主管作战的副总长陈赓召来询问。陈说,18日那天粟总长召集皮定钧和作战部王尚荣等研究了福建前线作战问题,认为可准备攻打马祖列岛,并立即准备。能三个岛同时攻击有利于速战速决,但应由南京军区许世友等研究后再定。彭说,毛泽东批准的1954年8月13日军委关于东海沿海作战方针,你们也参与了制定。明确规定每次只选定一个最小最弱的敌占岛屿攻击,求得战则必胜。打一江山岛就是按这个方针选定的。我曾告张爱萍要用牛刀杀鸡。现仍要贯彻执行这一方针。看来总参、南京军区、福建军区对这一方针还没有完全理解和掌握好。选定攻击目标后报军委经毛泽东主席批准后再着手准备。现可先告南京军区打马祖准备工作暂停,听候新的指示。
6月23日彭德怀就此电报事向毛汇报。毛说,日前台海局势以平静为好。彭说,现在看、陈赓、许世友等对军委8月13日的方针还缺乏深刻认识。为此提议请叶飞、许世友来北京开一次会,有利军委方针的掌握和贯彻。毛表示同意。
7月8日彭德怀主持召开福建沿海会议。说,6月18日开会时只是告皮定钧要加紧全面准备,并未说三个岛要同时攻击,皮定钧可能把全面准备误解为全面攻击。但根据那天的会议记录,皮定钧同志未传达错误,此事应该由粟裕自己负责。
事后彭德怀把审定的记录打印出来呈毛泽东。毛于7月13日在记录上批示:“6月18日讨论这样大的问题,不得中央批准,是很错误的。”