4日和5日，菲律宾武装部队总参谋长与陆军参谋长相继站出来，否认军方准备发动政变的传言，保证军队忠于宪法和总统阿基诺三世。
事情起因是1月25日清晨，菲律宾警察特别行动队潜入南部马京达瑙省，击毙一名头号恐怖分子，撤退时遭叛军武装包围，牺牲44名特警。据菲律宾 Rappler新闻网称，事后，警方质问军队“当时为何不迅速前去驰援被围攻的特警”。阿基诺也称，特警部队未能同军队进行有效协调。许多军警人员不满阿基诺处理事件的方式与态度，包括殉职警员遗体运抵首都马尼拉时没有前往迎灵，以及迟迟不对外释疑，兵变传言随后四起。
菲律宾武装部队总参谋长卡塔潘上将4日否认部分官兵正密谋军变。卡塔潘说，阿基诺三世是通过合法程序当选的国家领导人，应该让他完成任期。代理警察总长艾斯皮纳4日下午也表示，或许有个别警员对总统有不满情绪，但这正是考验全国上下是否团结的时刻，警方完全支持总统阿基诺三世。
5日，陆军参谋长伊里韦里中将也站出来澄清政变谣言。据菲律宾Rappler新闻网5日报道，伊里韦里在第4步兵师成立45周年的纪念仪式上表示，所谓政变阴谋完全是无稽之谈，军队完全站在阿基诺政府和人民背后。菲律宾总统新闻办公室秘书也表示，总统下定决心要在2016年6月“以最好的方式”完整地结束任期，不会因为1月25日的南部冲突事件辞职。
