胡塞运动很快发展成一个叛乱组织，给总统阿里·阿卜杜拉·萨利赫构成严重挑战。萨利赫是世俗派扎伊迪政客，以不择手段而著称。身为暴君的他决心铲除与沙特接壤的也门北部省份萨达的叛乱活动。萨利赫谴责胡塞武装谋求推翻他，并且实施分裂主义计划。胡塞武装则坚称，他们的目标是为扎伊迪派争取权力。近10年中，双方展开了残忍的战争，导致成千上万的人或死亡，或流离失所。
开战不久，胡塞就被也门政府军打死，但他生前领导的运动在其弟阿卜杜拉-马利克·胡塞接过帅印后继续蓬勃发展。2009年，政府和胡塞武装之间的冲突达到高潮，当时沙特空军加入了也门政府。这项联合行动并不成功，胡塞武装暂时攻占了沙特境内的2座村庄。当时，沙特据说开始减少部分边境地带的人口，因为当地人对扎伊迪派表现出一些同情。
在那之后，战争久拖不决。胡塞武装提出邀请伊拉克最受欢迎的什叶派领导人、以温和而著称的阿亚图拉阿里·西斯塔尼在交战各方之间进行调停。但这一呼吁无人理睬。沙特神职人员穆罕默德·阿里菲称西斯塔尼是“异教徒”。与此同时，胡塞武装在意识形态上更接近于伊朗。
对胡塞武装来说，“阿拉伯之春”运动2011年来到也门是天赐礼物。当人们走上街头支持民主时，以前不民主的胡塞武装加入了他们。愈演愈烈的抗议运动结束了萨利赫37年的统治，副总统阿卜杜拉布·曼苏尔·哈迪在一场没有对手的总统竞选中获胜。然而，沙特支持下的哈迪统治昙花一现。萨利赫及其在军队和情报机构中的庞大网络参与了胡塞武装推翻哈迪的行动，后者被迫逃往沙特。如今，胡塞武装及其伙伴控制着萨那和也门的大部分地区。胡塞武装实施了恐怖和恐吓行动，如果不与他们的夙敌萨利赫在战术上结盟，他们是不可能取得飞速进展的。沙特将目光聚集在胡塞武装身上，就好像如今的混乱是该组织造成的一样。
伊朗是罪魁祸首？
阿拉伯世界最贫穷的国家也门发生的内战折射出各种各样宗派和部落之间的激烈斗争，他们各自有着令人质疑的地方。但完全怪罪伊朗，而将沙特描述成仁慈的大国却是虚伪的。
伊朗参与的性质和程度被夸大，有时被故意歪曲了。例如，根据“维基揭秘”披露的文件，当萨利赫当年听取关于美国无人机在也门坠毁的汇报时，他公开坚持认为，无人机是伊朗的，而它正在搜集情报。2009年，也门在其领海截获一只小船，声称它运载了注定要落到胡塞武装手上的伊朗的武器和现金。但伊朗否认了这些指控。
在一份发往华盛顿的秘密电报中，美国驻也门大使斯蒂芬·塞凯写到，“大多数当地政治分析人士报告说，胡塞武装是从也门黑市上获得武器的。”他引述也门一位高级官员的话说，“胡塞武装可以轻而易举地从也门境内获得武器，要么是战场上的缴获，要么是从腐败的军事指挥官和士兵那里购买的……军方称这些武器来自伊朗是为了掩盖其失败。”
