在发动机流道内安装预冷却器会造成重量增加、进气畸变和压力损失，同时，采取密集管路形式的预冷却器极易产生结霜问题，严重影响换热效率并造成流道堵塞增大压力损失。因此，轻质高效的预冷却器是预冷却技术能够取得突破的重要一环。S-发动机在预冷却器的研究方面继承了ATREX发动机的成果，在换热效率和重量方面取得平衡，通过加大冷却管路的间隙来解决结霜问题，今后的飞行试验验证也将采用双冷却回路的模式，采用其它惰性气体来替换液氢作为冷却介质，提高安全性。
JAXA于2005年制定了空天发展路线图，所关注的四大内容之一就是发展高超声速吸气式飞行器，其中预冷却高速涡轮发动机的发展是其动力技术发展的主要方向。尽管日本制定的高超声速发展路线图和预冷却高速涡轮发动机技术研究项目的公开背景均为民用，但所发展的各项技术无疑也能够转化应用于军用高超声速武器，为其今后发展高超声速武器装备奠定坚实基础。
