不过此时国产“太行”发动机尚未成熟，仍然需要AL-31F顶替，因此作为定型后生产的01批飞机，空1师受阅的歼-11B编队仍然使用AL-31F发动机。
但眼力好的人或许可以看见在编队尾部有1架外形有所不同的双座战机，作为在空中拍摄整个编队的拍摄机，它就是歼-11B的配套双座机型——歼-11BS。
由于中俄签订苏-27生产线引进协议时，并没有引进双座型苏-27UBK技术资料的内容，而是配套歼-11的装备引进了几十架苏-27UBK。所以随着歼-11B的立项，其双座型歼-11BS也被提上了议事日程。相比苏-27UBK，歼-11BS在增加机体复合材料使用，并基本沿用歼-11B的国产航电设备和武器系统的同时，还进行了两项重大改进。
挂载霹雳-12型主动雷达制导空空导弹，使用“太行”发动机的歼-11BS
其一是使用了数字式电传操纵系统。在研制歼-11B的时候，由于时间要求太过紧迫难以完成全新飞控的研制和测试，空军没有要求对歼-11的模拟式电传操纵系统进行更换，只进行国产化即可。但为了后续型号能站在更高的台阶上，601所在研制歼-11BS前就开始自筹资金发展自动化、智能化程度更高的数字式电传操纵系统，并在歼-11BS上得到应用，为歼-11系列后续型号发展中实现“飞推一体”乃至“飞火推一体”控制奠定了基础。
2014年拦截美国海军P-8A巡逻机的中国海军歼-11B战斗机
其二是从原型机开始就使用国产FWS-10A“太行”涡扇发动机。前面提到了歼-11B在定型时仍然使用AL-31F发动机，而歼-11BS则一直使用“太行”进行着试飞定型工作，和几架歼-11试验机一起最终盼到了“太行”的堪用乃至成熟。2010年，歼-11BS完成定型并投产，“太行”也开始安装在之前已经生产出机体但缺装发动机而无法交付的一批歼-11B战机上，并持续稳定交付。歼-11家族为“太行”的成熟做出了无可替代的巨大贡献。
目前，全面实现国产化的歼-11B/BS战机已经装备了多个空军和海军航空兵部队，在包括整建制出动西南边境进行警巡飞行，2014年在南海与美国海军P-8A巡逻机紧急对峙等日常军事行动中证明了自身价值。而依靠其先进的航电和武器系统(例如其机载火控雷达是国内机载机械扫描雷达中性能最强的一种，体积重量只有歼-11上的俄制N001E的一半，但探测距离、探测跟踪目标数量、抗干扰能力等方面都有成倍提升)，在空军每年组织的“红剑”体系对抗和“金头盔”自由空战竞赛中，它们近来也屡有上佳发挥，多名飞行员斩获“金头盔”称号。
