另据《凤凰卫视》13日报道，国民党“立委”赖士葆对此表示，此“公投法”修改草案通过将出现两大问题，首先，把双门槛变成单门槛，只要总投票的人数超过四分之一就算过了，而这里面包括大家最敏感、最不愿意看到的“领土”的改变，这个很明显的就是走向“法理台独”。
其次，对于所有两岸未来的任何协议要先经过“公投”才可以谈，这样的话大概两岸未来协议会很难谈成。
立法院女人间的战争
赖士葆表示，如果让台湾陷入一个长期动荡不安，有走向“法理台独”可能性的话，这对台湾人民来讲是一个很大的灾难。赖士葆预测，蔡英文到最后可能会对该条文“踩刹车”或者做若干的修正。
社科院台湾研究所研究员王建民12日接受《环球时报》采访时表示，如果民进党真的要把“领土变更”纳入公投，那么就是给未来“法理台独”留下巨大的空间，这是非常危险的。
立法院发生肢体冲突
他直言，公投泛滥对台湾社会本身也会造成很大的威胁，甚至把台湾搞垮。至于修正案规定对两岸协商严加审查，王建民说，这预示着接下来蔡英文上台后两岸的协商将变得几乎不可能，协商、协议变得非常不容易。
在客观上会阻碍两岸关系的发展；尤其是如果把它写进法律修正案中，就会变成长期性的东西，一旦涉及重大协议，如两岸统一问题等，就会直接阻碍两岸的协商。
