与商人称兄道弟
倪发科为政颇高调，作风专断，也爱宣传。早在担任六安市委副书记时，他就与时任“一把手”不睦。
2005年，一场“闹剧”将倪发科的个性淋漓展现。王姓退休官员回忆说：“2005年，只不过是安徽电视台播放他的一个专访，就要求全市各个部门、县市都组织收看，看了还要写汇报、写心得。当时还进行了电话抽查，没有看的要求第二天补看。”
相较之下，倪发科与一些商人的相处却十分融洽。
据纪检系统知情人透露，倪发科此次接受调查，与安徽大昌矿业集团有关。该公司董事长吉立昌早期从事大米买卖，与倪发科关系甚密。在酒桌上，吉立昌曾搭着倪发科的肩膀称“发科老弟”。
倪发科被带走调查后，吉立昌随即被带走协查。举报人士说，倪涉嫌在大昌矿业谋取不当利益。举报人和霍邱官场人士都称，倪发科在大昌矿业持有一定比例的股份。“以暗股的形式，而且是大股东”。不过这一说法没有得到官方证实。
大昌矿业2001年起进入六安霍邱矿区考察，取得了吴集铁矿南段26.4平方公里的探矿权后，截至2010年，累计投资13亿元进行矿山建设，对霍邱县GDP和税收的影响举足轻重。
在当地人印象中，该公司颇受照顾，即便在征地拆迁中动武伤人，亦不会受到惩处。2009年7月，霍邱县人大常委会全票通过一份同意奖励大昌矿业6亿元的决议，而当年霍邱县政府一年的本级财政收入只不过7个亿。后因媒体曝光，省领导过问才作罢。举报人称，在这项奖励政策中，倪发科发挥了作用。
今年5月，“6亿重奖民企”的导演，六安市副市长，原霍邱县县长、县委书记权俊良，被纪委带走谈话，至今未归。
6月9日，霍邱县政府办公室副主任、县安监局党组书记张永在其家门口不远处死亡。霍邱县委宣传部消息称，经当地公安部门周密调查，认定系坠楼死亡，排除刑事案件的可能。
一位知情人士透露，张永死前曾接受纪委部门的问话，内容与倪发科、权俊良的案情有关。“被带走四天左右，回来后情绪抑郁，第二天就出事了。”
倪发科在六安经营了八年，有分析称，他的落马有可能成为震动安徽官场的一宗窝案。
朱镕基受骗记
1998年5月，时任国务院总理朱镕基前往安徽省南陵县视察该县落实国家粮食收购政策的情况。当地政府从外地调运1031吨粮食到总理将要视察的南陵县峨岭粮站，连驾驶员在内前后二百余人通宵大干了四天，“人造”出粮食满仓的景象。
当时，倪发科任芜湖市委副书记，事发的前一天，他还领着一大帮人赶去验收粮仓，准备应对朱镕基的视察。
造假揭穿后，朱镕基大怒。据《朱镕基讲话实录》一书记载，1999年2月朱镕基谈信访工作时候的一段讲话为：“不久前我到安徽省南陵县去察看粮食仓库，在我没去之前粮库都是空的，后来他们把一些粮站的粮都搬过来，摆得整整齐齐。连我都敢骗，真是胆大包天!”
2004年，作家陈桂棣、春桃所著的《中国农民调查》亦披露了此事。据《财经》杂志，六安一位离休老干部回忆，出于对倪发科的爱护，他寄了一本给倪，并附了一封信。
“他给我回电话表示了谢意，解释说，有这个事，但不全是书里写的那样，自己的介入没那么深。”这位老干部说。
春香;《财经》杂志第360期，《倪发科“旧病”复发》，作者：张鹭;《廉政瞭望》2013年第12期，《倪发科落马调查》，作者：徐浩程
