在决策中同样不能缺少的还有执行和评估程序。余晖说，除了我们现在看到的这份方案和三年实施方案，还有很多配套的方案将陆续推出，虽然未来3年的任务非常明确，但可以预见其执行过程会更加复杂。因此同样重要的是对政策执行结果的评估。余晖说，我们现在一个最大的问题是对公共政策的执行缺少公开、透明的评估，甚至根本就没有评估，没有评估也就没有对公共政策的修改和终止程序。因此，评估很重要，很多西方国家为了保证评估的客观公正大都采用第三方评估方式，这值得我们借鉴。
余晖说，从医改方案出台的整个过程来看，具有高度的透明性和公开性，它广泛地吸纳了各方的意见和智慧，进行了充分的利益表达，最后达成了基本的共识和妥协，正是这一过程保证了医改方案的民主性和科学性，这是一个非常成功的公共决策案例。事实上，我国各领域的改革正在全面推开，这些改革要取得成功，一个民主、科学的决策过程必不可少。比如说，我们正在酝酿推进的教育体制改革、部分行政性垄断行业的改革等都是涉及面广、影响巨大，利益关系复杂的改革，要想实现改革的平稳过度，达到既定的目标，医改方案的成功出台或许可以起到一定的示范作用。
