尽管花园生物的创业板首发申请获得了证监会的审核通过，但外界对公司的质疑声并没有因此停止。事实上，在除了媒体质疑的公司股本变更问题外，公司的关联方资金占用问题以及同业竞争问题，仍是充满隐患。
花园生物在完成改制后，仍存在大量的关联方资金占用情况，尽管公司称2009年6月已彻底解决了该问题，但由于公司关联方众多，同业竞争解决不够彻底，由此存在的隐患仍不能忽视。
关联交易众多
创业板上市公司有如此多的关联方实属少见。招股书显示，浙江花园生物高科股份有限公司是由花园有限于2003年10月整体变更设立的股份公司。公司主营维生素D3上下游系列产品的研发、生产和销售。
公司的直接控股股东为浙江祥云科技股份有限公司，持有公司3,438.54万股，占总股本的50.57%。此外，祥云科技还还拥有控股子公司花园药业。
公司间接控股股东为花园工贸集团有限公司，花园集团目前持有祥云科技10,049万股，占祥云科技总股本的86.63%。花园集团是一家大型多元化民营企业集团。截至招股说明书签署之日，花园集团直接控股的企业或单位共有五家，包括：祥云科技、花园控股、花园旅游、花园技校、花园幼儿园，分别从事实业投资和股权管理、旅游、教育等业务。
公司的实际控制人为邵钦祥先生。邵钦祥先生持有花园集团60%股权；邵钦祥先生的两个女儿邵燕青、邵燕芳分别持有花园集团20%的股权。
在如此庞大的体系下，花园生物想要规避关联交易都难，公司随便喘口气都涉及到关联交易了。2007年至2009年，在主营业务方面，花园生物向同一控制人邵钦祥控制的花园药业、杭州进出口、海鹏贸易三家关联公司销售产成品，销售总额分别为689.26万元、637.93万元、731.10万元，占主营业务收入比例为5.58%、4.83%、3.72%。其中对杭州进出口销售的产品主要为饲料级维生素D3油、化妆品级羊毛醇；对海鹏贸易销售的产品主要为饲料级维生素D3粉、饲料级维生素D3油、化妆品级羊毛醇；对花园药业销售的产品主要为维生素D3酯或维生素D3结晶。
其他业务收入方面，如让售材料，花园生物与关联方花园药业、花园服装、洛神科技、花园建设发生的关联交易金额近三年来分别为0.67万元、0.82万元、0.98万元；提供劳务方面，花园生物与关联方花园服装、花园药业、花园集团发生的关联交易金额分别为127.22万元、50.88万元、19.46万元。
为了解决关联交易问题，花园集团先后注销了海鹏贸易和志成贸易，花园药业则申请了注销维生素D3药品批准文号，未来不再生产维生素D3原料药，因而不会再向花园高科采购商品。
资金占用净额大
虽然2008年5月，花园生物就进入了上市辅导期，但在关联方众多，关联交易频繁的情况下，花园生物很难不发生关联方资金占用问题。2007年至2009年上半年，公司存在花园集团资金占用情况，资金占用净额分别为17,563.24万元、14,881.73万元、13,706.38万元。
由于关联方大量占用资金，2007年至2009年花园生物经营活动产生的现金流净额波动较大，分别为19,817.24万元、2973.96万元、9009.75万元。若剔除该因素的影响，公司经营性现金流量净额分别为156.61万元、-1,328.52万元、3,488.37万元，由经营所产生的现金流基本可以保障公司生产经营的资金需要。
与此同时，公司的应收账款也随着关联方占用资金而波动。2007年至2009年，花园生物应收账款分别为2334.32万元、1283.59万元、5131.03万元。2009年末公司的应收账款净额较2008年末增加了299.74%，占2009年12月31日全部流动资产的24.84%。应收账款的较大比重导致了公司资金的大幅占用，并且有可能因为市场的变化，导致应收账款发生坏账损失，从而影响公司的经营业绩。
而公司2008年末其他应收款余额较2007年增加5,774.41万元，主要是2008年末花园集团及关联方资金占用余额6,769.21万元，包括2008年结算的关联方资金占用费784.15万元(其中464万元为2009年补提2007年资金占用费)。
虽然花园生物一再强调，截至2009年6月30日，公司已消除了关联方资金占用，但公司关联方如此众多，就连打个喷嚏都有可能牵扯到关联交易，这样的公司如何让投资者放心？
