在仟源制药的招股说明书中，除了没有提及全民所有制企业的前身这个信息以外，企业或将在不久的将来面临搬迁一事，公司也是只字未提，而此信息或将为公司上市后的股价波动埋下重重的一笔。
来自于仟源制药2010年3月的公司会议纪要显示，公司认为，新项目部是仟源制药的未来，公司或将根据大同市政府规划2-4年完成企业搬迁。
仟源制药位于大同市开发区，开车距离大同市中心约20分钟的路程，在近两年大同市大搞城市建设的浪潮下，目前开发区内的工业企业已经成为了将要被政府搬迁的对象。
根据大同市御东整体规划，目前在大同开发区内的制药企业都将被搬迁到大同第一、第二医药园区里面。目前大同市开发区的土地使用用途被重新调整为住宅以及商业用地。
虽然目前该规划已经上报但还未获得批复，但是与该规划有关的相关事宜都是在按此规划着手实施。而对于搬迁企业新项目用地如何获得的问题，相关部门的负责人表示，肯定会通过招拍挂的形式进行。
在大同开发区内的制药企业并非没有被搬迁的先例，该园区原先拥有制药企业14家，某外资制药企业阿拉宾度因为排污问题被责令搬离开发区，而其落脚点就是目前大同市御东整体规划中提及的第二医药园区。而与仟源制药一路之隔的威奇达也已经在2010年完成了部分生产线的搬迁工作。
根据规划，目前包括威奇达、仟源制药在内的多家制药企业都是未来的搬迁对象。
对于这些未来将被搬迁的制药企业的窘境，大同市开发区管委会分管工业的副主任童进璧对记者表示：“仟源制药也是属于搬迁的对象之一。开发区的意思是想把制剂的企业留下，制剂的企业一般没有污染，或者污染特别小，把原料药的制药厂搬出去。在搬迁的问题上，仟源制药不想搬，但是上面催它，这就不属于我们开发区能管的事情了。”
对于企业搬迁的问题，仟源制药办公室主任李雪飞对记者表示：“未来仟源制药可能搬迁也可能不搬迁。”
相比仟源制药的含混说法，大同市开发土地局办公室的工作人员给予了记者坚定的答复：“根据大同市规划，目前在大同经济技术开发区的制药企业都要搬迁到第一医药园区或第二医药园区去。正常情况，不存在制药企业不被搬迁的问题。”
在对仟源制药在职员工的采访中，企业面临搬迁的问题也得到了再次印证。
相比多方面信息印证企业将面临搬迁问题的情况，仟源制药在招股说明书的风险提示中并未提及上述内容。
