投资操作不尽合规的现象亦屡屡现诸宝盈基金。
“意见函”指出，从2009年9月7日开始，拟任投资总监夏和平多次通过电话指示原投资总监陆万山对宝盈泛沿海基金进行操作，指示内容具体至个股买卖数量和价位。但是，夏本人是在2009年12月26日正式聘任为基金经理，此前并不具备基金经理任职资格。
此外，深圳证监局2008年、2010年对宝盈基金现场检查，均发现公司研究和投资力量薄弱的问题：多数行业研究员一人要同时负责四个以上的行业，难以为投资提供有效支持。
管理层争议
“宝盈基金今天的混乱，有股东的原因，也有高管和团队的原因。”宝盈基金内部人士表示，“现在的矛头多对准了总经理陆金海。”
2006年宝盈新股东刚刚就位，中铁信托和外经贸信托就曾对陆金海担任宝盈基金总经理发生严重分歧，外经贸信托公开提出反对意见，质疑陆金海乃是中铁信托推荐的总经理，并非市场化招聘而来。
之后的几年时间中，宝盈基金虽然努力经营，保持着年发两只基金的速度，但是仍然被后来者不断超越。
2009年，宝盈基金资产管理规模在全部60家基金公司中排名第43位，总份额132亿元，较2008年下降7%。宝盈泛沿海在股票型基金中排名倒数第三，宝盈鸿利基金在偏股混合型基金中排名倒数第一。
“意见函”显示，2009年以来，宝盈基金公司投委会加强了对旗下基金的统一操作，多次大幅度调整仓位，并在短期内提出方向相反的投资策略。如2009年1月18日，投委会要求各基金在两天内按照规定比例提高股票仓位，而2月5日，投委会又降低各基金仓位。3月25日，投委会要求所有基金在三至五个交易日内进行减仓，4月2日，投委会再次要求各基金在三至五个交易日内加仓。
投委会还强制规定各基金短期内批量买卖个股种类和具体数量。
证监局检查发现，2009年，宝盈基金投委会多次下令各基金买卖股票，而且明确规定卖出的具体数量，甚至精确到个位数，而上述决议并未见相关决策依据。而且，宝盈基金旗下基金股票仓位呈现整体联动趋势，且调整幅度较大。
2010年2月初，深圳证监局召集宝盈基金三家股东负责人谈话，会议提及陆金海去留问题。市场传说陆金海已经推荐长城基金的汪钦担任自己的继任者，而中铁信托似乎默许了这一提议。
“现在的问题要从股东层面开始整治，只有把公司治理结构理顺，才可能重新发展。”一位接近监管层的人士表示。
